女巫的預言：一個孩子在另一個遙遠的世界，在不知不覺中拯救了人類，完成偉大的使命…
11歲的孤女萊拉，自小被探險家伯父艾塞列公爵送到牛津約旦學院寄養；一次的偷窺行為，知道有關「塵」的事：由黑暗本源中脫離出來，只會圍繞精靈定形的成人的一種難以測量的基本粒子與北極光中的世界，從此改變了她的生命…
院長答允寡婦考爾特夫人担任萊拉的監護人，並遷往倫敦居住，臨別時院長轉送萊拉一個由艾塞列公爵留下的會告知真相，預測未來，黃銅與水晶製成，貌似羅盤的真理探測儀！
萊拉在倫敦的生活由最初的新奇刺激變得處處受制，與夫人衝突漸多，對夫人遲遲未能兌現與她到北地探險深感不滿！
一次的宴會中，萊拉得知早前「吞人獸」誘拐貧民窟的孩子是奉獻委員會做的，她的朋友約旦學院的廚房學徒羅傑的失蹤可能與他們有關；最讓萊拉震驚的是委員會的主持人是考爾特夫人，她更請得武裝熊族將公爵軟禁在斯瓦巴城堡！
萊拉逃出來被吉卜賽人救上船，他們雇用了熱氣球飛行員史科比，並正準備前往吉卜賽人之王約翰法商討尋找被誘拐到北地的吉卜賽孩子，他們尋求先知克朗的愛人拉普蘭的女巫帕可拉女王協助！
克朗告訴萊拉艾塞列伯爵與考爾特夫人才是她的親生父母！
萊拉解讀羅盤，指示被放逐的武裝熊族歐瑞克奪回自己的甲冑後，得他答應協助前往波伐格的實驗基地營救行動；她又透過羅盤指示與歐瑞克到村落，找到一個被割掉精靈的吉卜賽孩子托尼，並將失去精靈的他救回營地，可惜最終他亦死去！這時營地被攻擊，混亂中萊拉被山蒙得獵人捉走並賣到實驗基地！
萊拉找到羅傑，從其他孩子口中知道精靈被困的地方，並放走他們！萊拉與羅傑計劃放走其他孩子，她卻不小心被基地職員捉住，差點被送去切割精靈與她的聯繫，幸好被考爾特夫人及時阻止；夫人欲取羅盤，萊拉設計讓間諜蜂攻擊夫人，並引發基地爆炸，與其他孩子乘亂逃走！
吉卜賽盟軍趕到戰勝韃靼土兵，救出孩子，而萊拉、歐瑞克和羅傑被史科比救上熱氣球，由帕可拉拉動飛向斯瓦巴營救公爵，途中被峭壁鬼族襲擊，萊拉跌出熱氣球被熊群捉到武裝熊族王雷克森的牢房囚禁！
萊拉知道熊王的願望是有自己的精靈，於是將計就計讓他答允與正在趁來營救她的歐瑞克單挑；熊王中計，歐瑞克戰勝為王！萊拉從羅盤得知考爾特夫人正率領軍隊到來支援，萊拉、羅傑與歐瑞克搶先趕到斯瓦巴城堡與艾塞列公爵相認！
公爵道出自己的計劃…
「塵」既成萬物，來自渾沌無名的元素，教會將「塵」理解為原罪的基本分子，如果將人類的身體與精靈的聯繫分割，就永遠不會被原罪侵入；公爵計劃進入極光中的世界，調查「塵」的起源，並試圖毀滅它，讓死亡永遠終結，人類不再需要救贖，不再需要教會甚至信仰！
公爵瞞騙萊拉帶走羅傑，利用分割他與精靈的連結所釋放的能量來炸出通向另一個世界的缺口！
萊拉尋至，已太遲，羅傑死了！
夫人尾隨至，公爵邀她一同穿越缺口，被拒！公爵毅然走入缺口…
萊拉為尋找「塵」的真相，帶著羅盤也進入了另一個世界…
地磁嚴重受擾，世界彷彿被扯碎！
