S大學一年級女生尚小蝶一覺醒來在奇異的蝴蝶（左邊翅膀是美女圖案，右邊是骷髏的）指引下到校園內的幽靈小溪撿到一個紅色書包，平凡的生命從此起了變化！
白俄人卡申夫在中國發現罕有的「鬼美人」鳳蝶而聞名，他在上海創辦葉卡捷琳娜醫院並在附近秘密培育出「鬼美人」；牠們具有高度智商，且是昆蟲之王！卡申夫的養女伊蓮娜與中國商人之子黎逍遙定婚，卡申夫因嫉成恨替她注射用「鬼美人」調配的有毒血清！其後他狂性大發，手持手術刀捅死醫院所有人，而他亦被成千上萬的「鬼美人」攻擊致死。
慘案的唯一生還者伊蓮娜與黎氏結婚，不久誕下一女，黎氏遵遺願將難產而死的伊蓮娜葬在醫院附近，即傳聞中的蝴蝶公墓。
黎氏將女嬰寄養在親戚家，她長大後結婚生女（祝蝶），不久被丈夫遺棄；她到過公墓後觸發遺傳自母親的蝶毒，幸運地被山區的中醫用以毒攻毒法去除病毒，她回到已成廢墟的醫院遺址隱居！
於昆蟲研究所工作的祝蝶與男友發現「鬼美人」繁衍棲息地蝴蝶公墓，不久男友中了空氣中的磷粉毒而死，祝蝶與小蝶父結婚，誕下小蝶後難產而死！
S大女生白霜破譯了舊生野生的一首詩＜蝴蝶公墓＞，尋到公墓；她受「鬼美人」攻擊中毒，遇上在深夜駕車迷路的三名同校生，四人最後遇上車禍，只得拍下事發前情景的孟冰雨身體無礙！
冰雨憑白霜留下的線索，尋到埋在幽靈小溪，內藏詩稿的鉛筆盒，再破解白霜在網頁內的公墓地圖，進而尋到公墓所在；冰雨中毒，她所捕獲的「鬼美人」飛脫，她遺下書包追捕，不慎墮入幽靈小溪！
小蝶在幽靈小溪撿到冰雨的書包，並發現了她拍下車禍發生前的短片及一本課堂筆記簿！白霜的妹妹白露率先憑冰雨的隨筆及姊姊的網頁尋到公墓，回來後亦死於非命……小蝶憑白露給她的8幀彩訊圖片、白霜的網頁尋到公墓，在許願牆許下醜小鴨變成天鵝的願望……學長陸秋水救出神智不清的小蝶……自到訪過公墓後，小蝶外形脫胎換骨，令人見前一亮！其間亦查得自己的血統：人類與蝴蝶基因的混合體〜半蝶人！
小蝶獨自到公墓尋求解救秋水身上蝶毒的方法！不知就裡的舍友陸雙雙、田巧兒等四人跟蹤到來，小蝶為救被舖天蓋地的「鬼美人」攻擊的舍友和秋水，捨身跳下打開的墓穴洞口，成功引開「鬼美人」，秋水追隨跳下，他們反而因禍得福，除去了身上的毒素！
