天使巴魯克與巴瑟莫查得考爾特夫人將萊拉帶到喜馬拉雅谿谷洞穴裡匿藏，並用藥使萊拉沈睡以躲避教會的追殺；威爾到湖邊營區取走查爾斯的裝備和食物後與天使前往萊拉的世界，途中遇上神國攝政王邁塔頓追捕，他們及時逃到另一世界；天使巴魯克說出神國雲山的祕密：造物主其實是天地初始由塵創造出來最強大的第一個天使，他欺騙後來誕生的天使自己是造物主，並建立神國，由邁塔頓担任攝政王；較有智慧、知道真相的天使均被放逐…經商討後，巴魯克先向艾塞列公爵報告情況，巴瑟莫跟隨威爾尋找萊拉！
女巫帕可拉回斯瓦巴告訴熊王歐瑞克，熱氣球飛行員史科比的死訊後，計劃與吉卜賽人趕赴協助公爵陣營；歐瑞克向史科比的遺體告別後，赴南方尋找熊族適合的居所！
巴魯克負傷見公爵，報告老邁的造物主已退隱，大權落在巴魯克的兄長以諾，即攝政王邁塔頓身上，他準備率領神國軍隊與公爵一戰，而匕首持有人與萊拉是勝負的關鍵…巴魯克傷重不治煙消雲散；公爵派遣巴澤狄保護女兒；與此同時，教會亦透過羅盤尋得萊拉下落，派出戈梅茲神父除去她！
瑪隆進入喜喀則，粒子透過易經指引去路，進入另一世界，遇到謬爾發族，並被載到聚落生活，從中她得到啟發，製做可以觀察粒子運動的望遠鏡！
威爾和巴瑟莫遇上為了生存移居到南方中亞的熊族！
牧羊少女阿瑪引路，威爾用匕首入洞，救萊拉逃走時，夫人用計使匕首斷裂成7片；這時公爵的間諜塔利斯騎士與薩瑪琪夫人尋至，要帶走威萊二人，威爾拾回碎片尋回熊王歐瑞克，救走被阿瑪用藥喚醒的萊拉；間諜跟隨，巴瑟莫溜走！歐瑞克替威爾修復匕首後回斯瓦巴，威萊二人決定到冥界（造物主為囚禁犯人而設的集中營）尋找羅傑和古曼！
夫人被帶去公爵的堡壘，她利用意念機逃回日內瓦見主席神父提供情報，公爵派遣洛克跟蹤；主 席從 夫人處取得萊拉的頭髮，引導炸彈追踪並炸死物主；夫人與洛克企圖阻止不果，炸彈向萊拉飛去…洛克與主席神父死去，公爵救走夫人…
威萊二人與間諜利用匕首進入死人城，由萊拉的死神陪伴，在湖岸捨棄精靈進入冥界；百萬個鬼魂跟隨威萊二人尋到羅傑、史科比與古曼；冥界守衛人首鳥妖帶領他們到靠近另一世界的開口處，古曼感應到飛彈靠近，匆忙地教威爾引開炸彈的方法…炸彈在不遠處炸出深淵，他們向邊緣攀爬，威爾切出窗口，鬼魂離開冥界；古曼、史科比前往協助公爵消滅幽靈，威萊二人亦到公爵領地與精靈匯合，遇到神國與聯盟軍作戰，威萊二人遇上被攝政王送離戰場的造物主，並從峭壁鬼族手中拯救了他，可惜他被一陣風吹得煙消雲散；這時間謀的壽命亦到了盡頭！
夫人利用意念機飛去雲山見邁塔頓，誘騙他到深淵；夫人與公爵合力消滅他，三人同墮深淵，同歸於盡！
威萊二人找到自己的精靈後逃到謬爾發族的世界，源源不絕的鬼魂跟進，化成粒子滋養大地，謬爾發族帶威萊二人見瑪隆！
威萊二人尋找為處罰主人的捨棄而故意躲避的精靈，被戈梅神父跟上；黃雀在後，巴瑟莫為保護他倆與神父同歸於盡！
叛逆天使賽芬娜爾向他們道出：300年來匕首製造的成千上百個開口，讓塵流入虛無，同時讓幽靈誕生；關上所有開口才可以阻止塵流失，否則宇宙失衡，一切有意識的生命將會滅絕！
經過商討後，他們決定留下冥界通向謬爾發世界的窗口，其他的窗口由賽芬娜爾遂一關上。
吉卜賽人到來接威爾、萊拉、瑪隆回自己的世界後，威爾忍痛折斷匕首！
萊拉失去了讀羅盤的天賦，她在牛津的蘇菲亞學院埋首研讀！
